Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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