Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CIPCQ9C0C6 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CIPCQ9C0C6 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms