Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
OTOP3Q7RTS5 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
OTOP3Q7RTS5 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
OTOP3Q7RTS5 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
OTOP3Q7RTS5 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
OTOP3Q7RTS5 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
OTOP3Q7RTS5 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms