Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
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