Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKN1Q16512 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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