Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATP6AP1Q15904 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms