Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NEDD8Q15843 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NEDD8Q15843 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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