Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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SIX1Q15475 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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SIX1Q15475 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SIX1Q15475 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SIX1Q15475 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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SIX1Q15475 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SIX1Q15475 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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