Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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