Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERPUD1Q15011 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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