| RUNX2 | Q13950 | SNORD11B-201 | ENST00000607707 | 90 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U6.92-201 | ENST00000636464 | 89 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPL42-202 | ENST00000393128 | 1983 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-91P-201 | ENST00000364746 | 163 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR524-201 | ENST00000385242 | 87 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL033519.2-201 | ENST00000403958 | 392 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1283-1-201 | ENST00000408494 | 87 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP181-201 | ENST00000410246 | 98 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092813.2-201 | ENST00000434540 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1012P-201 | ENST00000516606 | 109 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-117P-201 | ENST00000517041 | 158 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087664.2-201 | ENST00000522898 | 551 nt | TSL 4 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087441.2-201 | ENST00000529141 | 262 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3945-201 | ENST00000581853 | 98 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022335.1-204 | ENST00000590779 | 600 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCOC-AS1-203 | ENST00000609616 | 405 nt | TSL 3 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC040896.1-201 | ENST00000613819 | 479 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068205.3-201 | ENST00000636385 | 468 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | hsa-mir-548d-1.1-201 | ENST00000636914 | 97 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLITRK6-201 | ENST00000400286 | 4318 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGTPBP1-205 | ENST00000376083 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR8K3-204 | ENST00000641689 | 2380 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.27-201 | ENST00000362540 | 103 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.99-201 | ENST00000363138 | 105 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU5F-3P-201 | ENST00000363767 | 117 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.202-201 | ENST00000364083 | 110 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR586-201 | ENST00000385035 | 97 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR628-201 | ENST00000385229 | 95 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P39-201 | ENST00000398005 | 273 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD12B-201 | ENST00000410433 | 91 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP21-201 | ENST00000412558 | 336 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC121342.1-201 | ENST00000423914 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010531.2-201 | ENST00000465012 | 153 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL26P26-201 | ENST00000480251 | 434 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB3P3-201 | ENST00000510526 | 400 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP82-201 | ENST00000516707 | 92 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP402-201 | ENST00000517148 | 110 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.25-201 | ENST00000517242 | 134 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009107.1-201 | ENST00000561923 | 330 nt | TSL 3 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DISC1FP1-204 | ENST00000563681 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4680-201 | ENST00000580906 | 66 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025754.2-201 | ENST00000606491 | 432 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138825.1-201 | ENST00000618587 | 192 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL807742.1-203 | ENST00000637444 | 759 nt | TSL 5 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEB-203 | ENST00000397345 | 26202 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEB-209 | ENST00000427231 | 26202 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SMARCAD1-201 | ENST00000354268 | 4912 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MARCH7-203 | ENST00000409591 | 2147 nt | TSL 2 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PARPBP-201 | ENST00000327680 | 3014 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.158-201 | ENST00000363651 | 101 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD114-30-201 | ENST00000364448 | 72 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR300-201 | ENST00000401138 | 83 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP270-201 | ENST00000411361 | 118 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC123900.1-201 | ENST00000420390 | 96 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS15AP28-201 | ENST00000435088 | 386 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018634.1-201 | ENST00000437554 | 401 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO1P44-201 | ENST00000441935 | 243 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC110995.1-201 | ENST00000444185 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z68323.1-201 | ENST00000450365 | 519 nt | TSL 3 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011753.1-201 | ENST00000451001 | 220 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01203-202 | ENST00000456091 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093852.1-201 | ENST00000503587 | 266 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-193P-201 | ENST00000516723 | 65 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC040926.1-201 | ENST00000530195 | 238 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSBP1P1-201 | ENST00000555205 | 166 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYL12BP1-201 | ENST00000569826 | 507 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL031274.2-201 | ENST00000599419 | 203 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLEU2_2.2-201 | ENST00000615474 | 90 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007742.2-201 | ENST00000618226 | 398 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTPRQ-208 | ENST00000614701 | 8289 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1305P-201 | ENST00000364353 | 104 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1164P-201 | ENST00000364428 | 107 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-450P-201 | ENST00000364654 | 107 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD14D-201 | ENST00000384390 | 87 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1026P-201 | ENST00000384465 | 108 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR548B-201 | ENST00000385247 | 97 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-823P-201 | ENST00000391042 | 103 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P19-201 | ENST00000415864 | 321 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02532-205 | ENST00000430094 | 628 nt | TSL 5 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA40.9-201 | ENST00000515895 | 93 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP24-201 | ENST00000516478 | 95 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP281-201 | ENST00000516504 | 135 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091144.1-201 | ENST00000519573 | 138 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023442.1-201 | ENST00000531247 | 422 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002001.1-203 | ENST00000534002 | 267 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC126323.6-201 | ENST00000561701 | 451 nt | TSL 3 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5007-201 | ENST00000583098 | 95 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353621.2-201 | ENST00000605340 | 133 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.812-201 | ENST00000610788 | 101 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.784-201 | ENST00000613803 | 101 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01378-205 | ENST00000615833 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.787-201 | ENST00000616522 | 101 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.780-201 | ENST00000617336 | 101 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.801-201 | ENST00000619005 | 101 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PIK3C2G-203 | ENST00000535651 | 2497 nt | TSL 5 BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SIRT1-203 | ENST00000406900 | 3295 nt | TSL 2 BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FGF7-201 | ENST00000267843 | 5467 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |