Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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