Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RUNX3Q13761 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms