| RUNX3 | Q13761 | RNU6-567P-201 | ENST00000516746 | 107 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025871.1-202 | ENST00000518819 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EBAG9-207 | ENST00000531677 | 777 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACTG1P17-203 | ENST00000561222 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007598.1-202 | ENST00000561528 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBL5P4-201 | ENST00000562584 | 236 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUB1P3-201 | ENST00000564581 | 315 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004584.2-201 | ENST00000570407 | 410 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005899.2-201 | ENST00000584353 | 90 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012594.1-269 | ENST00000600489 | 628 nt | TSL 5 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL132822.1-201 | ENST00000617063 | 513 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087588.2-201 | ENST00000617667 | 426 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091925.1-201 | ENST00000623204 | 462 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCOC-201 | ENST00000338517 | 1864 nt | TSL 4 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FSD1L-201 | ENST00000374707 | 7062 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIK3C2G-203 | ENST00000535651 | 2497 nt | TSL 5 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TBC1D31-206 | ENST00000518805 | 2201 nt | TSL 2 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIPOL1-203 | ENST00000537471 | 5954 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.197-201 | ENST00000364004 | 102 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD115-32-201 | ENST00000364079 | 82 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA25B-201 | ENST00000365507 | 128 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-148P-201 | ENST00000384472 | 162 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-32P-201 | ENST00000411193 | 191 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRLN-201 | ENST00000414264 | 422 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP1B1P2-201 | ENST00000416196 | 106 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PMCHL1-202 | ENST00000423102 | 261 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01509-202 | ENST00000423523 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092423.1-201 | ENST00000430165 | 186 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP6-201 | ENST00000441810 | 138 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137792.2-201 | ENST00000443484 | 235 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000870.1-201 | ENST00000472927 | 406 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096711.1-201 | ENST00000510967 | 347 nt | TSL 5 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01337-201 | ENST00000515871 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-965P-201 | ENST00000516721 | 96 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002884.4-201 | ENST00000527589 | 594 nt | TSL 3 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022616.8-201 | ENST00000533569 | 253 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020661.2-201 | ENST00000560114 | 134 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PWRN1-203 | ENST00000564898 | 389 nt | TSL 5 BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104581.2-201 | ENST00000572227 | 430 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4419B-201 | ENST00000577260 | 68 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4303-201 | ENST00000581299 | 66 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4781-201 | ENST00000585250 | 76 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC044792.1-201 | ENST00000593294 | 196 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356055.1-201 | ENST00000602528 | 446 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC133104.2-201 | ENST00000615272 | 193 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138305.3-201 | ENST00000624988 | 240 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYLC1-201 | ENST00000329312 | 2106 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.11-201 | ENST00000362375 | 109 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.106-201 | ENST00000363189 | 100 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.9-201 | ENST00000363823 | 204 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-546P-201 | ENST00000383991 | 107 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.431-201 | ENST00000384086 | 102 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR17-201 | ENST00000385012 | 84 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1093P-201 | ENST00000391194 | 107 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590556.1-201 | ENST00000423231 | 483 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018865.2-201 | ENST00000423631 | 129 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO2P12-201 | ENST00000427426 | 682 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096644.2-201 | ENST00000429278 | 159 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EHHADH-202 | ENST00000440662 | 656 nt | TSL 3 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073325.1-201 | ENST00000443714 | 542 nt | TSL 4 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008243.1-201 | ENST00000504955 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.661-201 | ENST00000516003 | 99 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-307P-201 | ENST00000516743 | 106 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003123.1-201 | ENST00000526041 | 333 nt | TSL 2 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF4A1P12-201 | ENST00000551910 | 141 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP006219.1-201 | ENST00000580258 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007485.1-201 | ENST00000616755 | 206 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MESTIT1_1.1-201 | ENST00000618871 | 140 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090971.5-201 | ENST00000621102 | 293 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP162-201 | ENST00000257766 | 5063 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAGE12B-201 | ENST00000361446 | 117 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-490P-201 | ENST00000362985 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-76P-201 | ENST00000364509 | 141 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.577-201 | ENST00000384794 | 101 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR190B-201 | ENST00000401119 | 79 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1156P-201 | ENST00000410365 | 100 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009238.1-201 | ENST00000442165 | 424 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009237.6-201 | ENST00000446969 | 424 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01564-201 | ENST00000448327 | 566 nt | TSL 3 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1170P-201 | ENST00000515974 | 106 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC034114.1-201 | ENST00000520293 | 285 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021785.1-201 | ENST00000520780 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000755.2-201 | ENST00000526777 | 571 nt | TSL 5 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFA5P6-201 | ENST00000542110 | 379 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4448-201 | ENST00000584360 | 86 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPGP17-201 | ENST00000603780 | 214 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RMST_6.1-201 | ENST00000611980 | 203 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1248-201 | ENST00000629190 | 106 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC148-202 | ENST00000409187 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPR22-201 | ENST00000304402 | 2942 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XRCC4-205 | ENST00000511817 | 1636 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CENPCP1-201 | ENST00000533085 | 2578 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.112-201 | ENST00000363250 | 102 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.148-201 | ENST00000363557 | 117 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.252-201 | ENST00000364556 | 101 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-42P-201 | ENST00000364738 | 142 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.319-201 | ENST00000365138 | 92 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.445-201 | ENST00000384168 | 102 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNY1P14-201 | ENST00000384426 | 108 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |