Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CUL1Q13616 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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CUL1Q13616 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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