Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
MTMR3Q13615 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
MTMR3Q13615 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms