Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KRR1Q13601 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms