Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HDAC1Q13547 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HDAC1Q13547 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
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