Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ATRQ13535 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ATRQ13535 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ATRQ13535 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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