Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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TCIRG1Q13488 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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