Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MSLNQ13421 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MSLNQ13421 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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