Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTGDRQ13258 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTGDRQ13258 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTGDRQ13258 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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