Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL28Q13084 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL28Q13084 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms