Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXF2Q12947 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXF2Q12947 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXF2Q12947 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXF2Q12947 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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FOXF2Q12947 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXF2Q12947 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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