Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
STX4Q12846 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
STX4Q12846 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
STX4Q12846 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
STX4Q12846 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
STX4Q12846 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
STX4Q12846 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
STX4Q12846 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
STX4Q12846 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
STX4Q12846 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms