Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF3C1Q12789 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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GTF3C1Q12789 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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GTF3C1Q12789 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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GTF3C1Q12789 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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GTF3C1Q12789 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF3C1Q12789 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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