Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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