Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms