Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VAX2Q9UIW0 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VAX2Q9UIW0 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms