Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf135Q5VTT2 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms