Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TPRNQ4KMQ1 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TPRNQ4KMQ1 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms