Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IMPG1Q17R60 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
IMPG1Q17R60 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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