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| UPP1 | Q16831 | LINC01203-202 | ENST00000456091 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC022445.1-201 | ENST00000457499 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.653-201 | ENST00000459091 | 95 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | RN7SKP210-201 | ENST00000459176 | 261 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02293-201 | ENST00000548335 | 574 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | ACTG1P17-203 | ENST00000561222 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR3935-201 | ENST00000583472 | 104 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR5690-201 | ENST00000583739 | 73 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007229.1-201 | ENST00000590455 | 412 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | CERS6-AS1-202 | ENST00000594898 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
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| UPP1 | Q16831 | 7SK.7-201 | ENST00000603504 | 247 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | TEX41-243 | ENST00000614173 | 190 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF204P-201 | ENST00000416749 | 2397 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
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| UPP1 | Q16831 | RNA5SP489-201 | ENST00000410986 | 109 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
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| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.718-201 | ENST00000517110 | 102 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
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| UPP1 | Q16831 | LINC01206-214 | ENST00000610910 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC084781.2-201 | ENST00000615568 | 161 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC137590.2-201 | ENST00000619709 | 240 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| UPP1 | Q16831 | SYT14-201 | ENST00000367015 | 5094 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC131280.1-202 | ENST00000624067 | 4211 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | FGF7-202 | ENST00000560270 | 1688 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-222P-201 | ENST00000362438 | 107 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.140-201 | ENST00000363474 | 103 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.319-201 | ENST00000365138 | 92 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-17P-201 | ENST00000384245 | 107 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-18P-201 | ENST00000384527 | 107 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-541P-201 | ENST00000384709 | 110 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR153-2-201 | ENST00000385225 | 87 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA75.6-201 | ENST00000391318 | 127 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | PRELID3BP1-201 | ENST00000457142 | 540 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | SPAG11B-206 | ENST00000458665 | 444 nt | TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD19B-201 | ENST00000459623 | 84 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | ATP5EP1-201 | ENST00000510257 | 156 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.706-201 | ENST00000516933 | 99 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
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| UPP1 | Q16831 | ETDC-201 | ENST00000635820 | 180 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-874P-201 | ENST00000362390 | 105 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD115-3-201 | ENST00000363100 | 82 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
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| UPP1 | Q16831 | RNU6-611P-201 | ENST00000384276 | 104 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
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| UPP1 | Q16831 | MIR1262-201 | ENST00000408276 | 93 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC004866.1-201 | ENST00000411748 | 78 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL356379.1-201 | ENST00000414105 | 126 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC108667.1-201 | ENST00000428618 | 249 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC092423.1-201 | ENST00000430165 | 186 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
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| UPP1 | Q16831 | MTCO3P8-201 | ENST00000453691 | 755 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC132942.1-201 | ENST00000486753 | 483 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC022493.2-201 | ENST00000506122 | 481 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC025871.1-202 | ENST00000518819 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | GNAI2P1-201 | ENST00000541815 | 315 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
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| UPP1 | Q16831 | MIR5701-1-201 | ENST00000585138 | 82 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL031274.2-201 | ENST00000599419 | 203 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |