Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
UPP1Q16831 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
UPP1Q16831 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms