Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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