Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
USF2Q15853 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
USF2Q15853 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
USF2Q15853 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
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