Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms