Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SS18Q15532 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SS18Q15532 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SS18Q15532 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SS18Q15532 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SS18Q15532 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SS18Q15532 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SS18Q15532 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SS18Q15532 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SS18Q15532 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SS18Q15532 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SS18Q15532 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SS18Q15532 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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SS18Q15532 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SS18Q15532 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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