Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KARSQ15046 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KARSQ15046 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KARSQ15046 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms