Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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