Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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GBX1Q14549 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GBX1Q14549 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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GBX1Q14549 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GBX1Q14549 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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GBX1Q14549 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GBX1Q14549 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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GBX1Q14549 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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GBX1Q14549 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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GBX1Q14549 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GBX1Q14549 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GBX1Q14549 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GBX1Q14549 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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