Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1CQ13936 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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