Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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