Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
CUL4AQ13619 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL4AQ13619 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms