Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBB3Q13509 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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