Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SMAD4Q13485 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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