Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LSAMPQ13449 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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