Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP140Q13342 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP140Q13342 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP140Q13342 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP140Q13342 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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