Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NME3Q13232 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NME3Q13232 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
NME3Q13232 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NME3Q13232 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NME3Q13232 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NME3Q13232 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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