Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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ERCC8Q13216 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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