Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CBX3Q13185 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CBX3Q13185 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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