Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PPFIA1Q13136 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PPFIA1Q13136 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms